2004年经教育部批准，成立设施农业科学与工程系，同年9月开始招收设施农业科学与工程专业本科生，拥有设施园艺学博士点和硕士点。设施农业科学与工程专业以植物科学、农业工程、环境控制为基础，培养具备设施农业科学基本理论知识、科学研究方法和应用实践技能，且具有一定专业特长和创新性思维的应用复合型高级人才。累计培养本科生近300人、硕士研究生102人、博士研究生51人。
本系现有教职工11人，其中，教授2人，副教授6人，讲师2人，教学辅导员1人，其中博士学位8人，硕士学位3人。目前已形成中青年骨干教师为主体，业务水平过硬、年龄梯队合理的高素质师资队伍。近五年，主持和参与国家自然科学基金、国家大宗蔬菜产业技术体系、国家重点研发计划、全国重大农技推广和江苏省现代农业产业技术体系等国家和省部级科研项目30余项；申请国家专利30余项；在国内外期刊上发表论文100多篇；获省部级一等奖3项、二等奖2项。积极参与本专业国家规划教材的建设工作，主编出版了《设施园艺学》（第一、第二版）、《无土栽培学》（第一、第二版）、《设施作物栽培学》、《农业设施学》、《设施作物生长模型与专家系统》等国家级规划教材和面向21世纪教材9本。
本系设有设施作物栽培生理与生态、设施农业机械与装备、温室设计与制图计算机房、设施农业环境调控等相关实验室，拥有本科教学用室内植物工厂150 m2、现代化智能温室2400 m2、塑料大棚2000 m2等设施，配备无土栽培设施、根际环境监测、温室环境调控等先进设备。同时，注重与校外企事业单位共建实践教学和实习基地，先后建立金沙集团3354cm（宿迁）设施园艺研究院、南农大上海爱盛实践教学基地、徐州大宗蔬菜农科教合作人才培养基地、上海孙桥等基地10个，可满足本专业学生理论教学、基础实验、实践教学、综合技能训练和生产实习等要求。
系主任： 刘晓英
截至 2019年9月
